En el año 1999, el jesuita Rodrigo Zarasaga es enviado al barrio Mitre, en el municipio de San Miguel, a realizar tareas apostólicas.  Al encontrarse en medio de un contexto de pobreza extrema y de enorme retroceso del mercado laboral, vislumbra  la posibilidad de armar un proyecto para ayudar a la activación del barrio en todos sus aspectos.

Así, el 25 septiembre de 1999, Fundación Protagonizar inicia sus operaciones con un proyecto piloto en el Barrio Mitre, zona peri urbana del Municipio de San Miguel, donde desarrolla sus actividades con voluntarios afines a la Iglesia Católica (amigos de la Fundación) y con una mentalidad de servicio a la comunidad.

A partir de enero de 2004 y ante el crecimiento de sus operaciones, decide encarar de manera más agresiva sus retos, y es en ese momento que logra reclutar personal a tiempo completo y los envía durante tres semanas a una capacitación a Centro América (El Salvador y Nicaragua), donde realizan una pasantía por reconocidas instituciones.

Actualmente, Protagonizar atiende cerca de 1200 clientes. Cuenta con tres agencias y un personal estable de catorce profesionales; diez de ellos dedicados a la identificación de clientes y a la administración de los procesos crediticios, y cuatro encargados de la administración general.

Basándose en la propuesta de  ”El banquito de los pobres”, que Mohamad Yunus explica en su libro “Hacia un mundo sin pobreza”, el padre de Rodrigo, Carlos Zaragasa, le propone fundar un “banquito” en Mitre.